El Instituto de Ecología y Ciencias Ambientales (IECA) tiene como objetivos generar conocimiento científico sobre temas ambientales, recursos naturales y ecología; formar recursos de grado y posgrado calificados para desempeñarse en el ámbito profesional y académico, y proveer de información calificada a los organismos responsables de la gestión ambiental y a la sociedad en general, teniendo presente el interés colectivo. 

IECA coordina la Tecnicatura en Gestión de Recursos Naturales y Desarrollo Sustentable y la Licenciatura en Recursos Naturales que se dictan en el Centro Universitario de Rivera, además de participar en los cursos de las Licenciaturas en Ciencias Biológicas, Geografía y Geología y en la orientación de estudiantes de grado y posgrado.

Asimismo, mantiene la responsabilidad y coordinación general de la Maestría en Educación en Ciencias Ambientales que ya lleva 11 generaciones formadas, y que fue generada en conjunto con la ANEP, al tiempo que mantiene su vinculación con el PEDECIBA-Biología en las subáreas Ecología y Evolución y Zoología, y con el PEDECIBA-Geociencias en las subáreas Geografía, Oceanografía y Limnología, así como con la Maestría de Manejo Costero Integrado.

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